建立土壤健康微生物指标及其分子诊断体系。土壤特性和微生物组大数据将在土壤健康微生物指标的开发中发挥关键作用。在制定微生物指标时，必须充分考虑土壤类型、土壤环境和土地利用类型，需要评估土壤扰动和扰动消失后微生物的抵抗力和恢复能力，以获得更全面的综合数据库。大数据需要软硬件多层次支撑，同时对数据库进行优化整合，整合微生物组和土壤健康数据自动分析系统，更好地掌握我国土壤微生物组的宝贵资源和了解土壤微生物组驱动土壤健康的机制，为土壤健康评价中微生物指标的制定提供有力支持。此外，微生物指标的检测应进一步向快速、简便、高度自动化的方向发展，未来研究应加强样品采集、前处理、核酸提取、基因测序等全自动化一体化分子诊断系统的开发。等检测方法基因芯片、单细胞分选、全基因组扩增测序、光谱技术等分子诊断系统的研发、应用和推广。

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